Burg und Stadt Neunburg liegen auf einer Granitzunge , die sich in ost-westlicher Richtung bis an die Schwarzach erstreckt.
Der Ort liegt auf einer dreieckigen Hochfläche. Die Bergzunge erreicht eine Höhe von m über dem Meeresspiegel und liegt etwa 20 m höher als die beiden Flüsse. Die Lage war sehr gut für die Errichtung einer Befestigungsanlage geeignet, da man nur einen Halsgraben auf der Ostseite anlegen musste, um sich gegen einen Angriff von dieser Seite abzusichern.
Die alte Burg bzw. Die älteste Bebauung wird im Bereich des heutigen Pfarrhofes und der Stadtpfarrkirche vermutet; der heutige Kirchturm ist früher wahrscheinlich der Bergfried der Burg gewesen.
Hier wurde dann ein neuer Halsgraben errichtet und mit Mauern abgesichert; der frühere Burggraben wurde so zu einem Abschnittsgraben. Die Anfang des Jahrhunderts begonnene Burg- und Stadtbefestigung wurde im Jahrhundert vollendet. Bereits der Hussiteneinfall von soll an den Mauern der Stadt gescheitert sein. Herzog Johann der Neunburger soll die Befestigungsanlagen verstärkt haben.
Die Befestigung besteht aus einer Ringmauer mit einem vorgelegten Zwinger und Mauertürmen. An der Südseite lag davor ein breiter Weihergraben, ebenso vor dem östlichen Halsgraben. Dieser ist wegen seiner Bezeichnung den primates zuzurechnen und nicht den Ministerialen. Pertholdus de Nuwenburch , Bruder des genannten Pilgrimus, erscheint als Zeuge in einer Urkunde.
